Po ucieczce z "Racoon City Medical Facility" gdzie rozgrywała się pierwsza część filmu, Alice wraz z kilkoma osobami, które przeżyły, stara się uciec ze zniszczonego miasta. W tym samym czasie, na drugim końcu metropolii, do życia budzi się wszechwładne uosobienie zła, potwór Nemesis. Ten potwór to zmutowany Matt Adison, znany już z pierwszej części filmu. Celem kreatury jest zniszczenie całego życia w okolicy. Resident Evil jest już drugą adaptacją gry komputerowej.